Cuautlancingo se remonta a la época prehispánica, como lo demuestra el Códice de Cuautlancingo que narra eventos anteriores a 1521. Durante la colonia, fue una encomienda y parte de Cholula, y en 1895 se constituyó como municipio libre. Históricamente agrícola, evolucionó a un centro industrial a partir de la segunda mitad del siglo XX, impulsado por la llegada de empresas como Volkswagen de México en 1964.